子宫纵膈是先天发育中，双副中肾管融合中受阻所致。子宫纵膈和双角子宫的发生率为5%，子宫纵膈使子宫腔的对称形态发生改变，干扰正常生育功能。纵膈子宫即使怀孕，其胎儿在子宫内发育迟缓和胎儿子宫内死亡的发生率也较高。

胚胎正常发育时，于妊娠19～20周，两侧苗勒管融合形成的子宫内中膈将被完全吸收而消失。如果吸收过程受到内外因素影响而发生障碍，则可造成不同程度的子宫纵膈。近年认为细胞凋亡是胚胎期子宫中膈吸收机制之一。通过单克隆抗体和免疫组化分析发现：纵膈子宫上未发现调控凋亡的蛋白(Bcl一2)。因此，Bcl一2的缺失导致胚胎期子宫中膈的吸收障碍。

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